우리의료원은 2012년 12월 20일 보건복지부가 주최하는 2011년 공공보건프로그램(만성질환관리) 성과평가에서 탁월한 성적으로 우수기관에 선정되었다. 공공보건프로그램은 2011년부터 2015년까지 5년간 수행하는 제3기 공공보건의료사업중 하나로 대부분의 공공의료기관에서 수행하고 있다. 우리의료원에서는 공공보건사업팀에서 주관하여 실시하고 있으며, 부상으로 상금 50만원을 받았다.